Protein–RNA interactions for Protein: P22935

Crabp2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp2P22935 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crabp2P22935 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crabp2P22935 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crabp2P22935 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crabp2P22935 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 412.8 ms