Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edn1P22387 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edn1P22387 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn1P22387 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn1P22387 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Edn1P22387 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Edn1P22387 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edn1P22387 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edn1P22387 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Edn1P22387 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms