Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ms4a2P20490 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ms4a2P20490 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ms4a2P20490 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms