Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps6ka3P18654 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rps6ka3P18654 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka3P18654 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms