Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcna1P16388 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcna1P16388 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcna1P16388 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcna1P16388 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms