Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LcatP16301 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LcatP16301 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcatP16301 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcatP16301 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcatP16301 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcatP16301 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcatP16301 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LcatP16301 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LcatP16301 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LcatP16301 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LcatP16301 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcatP16301 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcatP16301 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcatP16301 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LcatP16301 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcatP16301 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcatP16301 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcatP16301 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcatP16301 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcatP16301 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcatP16301 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcatP16301 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcatP16301 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcatP16301 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcatP16301 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcatP16301 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcatP16301 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcatP16301 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcatP16301 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcatP16301 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcatP16301 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcatP16301 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcatP16301 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcatP16301 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcatP16301 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcatP16301 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcatP16301 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcatP16301 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcatP16301 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcatP16301 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcatP16301 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcatP16301 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LcatP16301 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcatP16301 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcatP16301 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcatP16301 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcatP16301 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcatP16301 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcatP16301 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcatP16301 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcatP16301 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcatP16301 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcatP16301 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcatP16301 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcatP16301 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcatP16301 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcatP16301 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcatP16301 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LcatP16301 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LcatP16301 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LcatP16301 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcatP16301 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcatP16301 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcatP16301 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcatP16301 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcatP16301 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcatP16301 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LcatP16301 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LcatP16301 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LcatP16301 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LcatP16301 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcatP16301 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms