Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P16294 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P16294 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P16294 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P16294 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P16294 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P16294 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P16294 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P16294 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P16294 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P16294 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P16294 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P16294 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P16294 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P16294 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P16294 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P16294 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P16294 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P16294 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P16294 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P16294 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P16294 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P16294 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P16294 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P16294 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P16294 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P16294 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P16294 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P16294 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P16294 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P16294 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F9P16294 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P16294 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P16294 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P16294 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P16294 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P16294 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P16294 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P16294 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P16294 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P16294 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F9P16294 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P16294 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P16294 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P16294 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P16294 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F9P16294 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P16294 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F9P16294 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F9P16294 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F9P16294 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P16294 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P16294 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F9P16294 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P16294 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P16294 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F9P16294 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms