Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkceP16054 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrkceP16054 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkceP16054 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkceP16054 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkceP16054 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrkceP16054 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkceP16054 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkceP16054 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkceP16054 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkceP16054 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkceP16054 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkceP16054 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms