Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd44P15379 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd44P15379 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd44P15379 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd44P15379 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd44P15379 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd44P15379 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd44P15379 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd44P15379 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd44P15379 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd44P15379 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd44P15379 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd44P15379 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd44P15379 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd44P15379 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd44P15379 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms