Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ntrk2P15209 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ntrk2P15209 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ntrk2P15209 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ntrk2P15209 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms