Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srp54P14576 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srp54P14576 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp54P14576 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srp54P14576 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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