Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntn1P12960 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntn1P12960 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn1P12960 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn1P12960 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms