Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga5P11688 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga5P11688 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga5P11688 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga5P11688 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms