Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FlgP11088 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FlgP11088 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FlgP11088 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FlgP11088 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FlgP11088 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FlgP11088 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FlgP11088 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FlgP11088 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FlgP11088 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FlgP11088 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FlgP11088 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FlgP11088 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FlgP11088 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FlgP11088 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FlgP11088 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FlgP11088 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FlgP11088 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FlgP11088 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FlgP11088 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FlgP11088 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FlgP11088 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FlgP11088 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FlgP11088 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FlgP11088 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FlgP11088 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FlgP11088 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FlgP11088 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FlgP11088 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FlgP11088 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FlgP11088 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FlgP11088 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FlgP11088 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FlgP11088 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FlgP11088 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FlgP11088 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FlgP11088 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FlgP11088 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FlgP11088 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FlgP11088 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FlgP11088 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FlgP11088 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FlgP11088 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FlgP11088 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FlgP11088 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FlgP11088 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FlgP11088 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FlgP11088 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FlgP11088 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FlgP11088 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FlgP11088 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FlgP11088 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FlgP11088 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FlgP11088 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FlgP11088 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FlgP11088 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FlgP11088 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FlgP11088 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FlgP11088 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FlgP11088 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FlgP11088 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FlgP11088 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FlgP11088 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FlgP11088 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FlgP11088 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FlgP11088 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FlgP11088 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FlgP11088 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FlgP11088 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FlgP11088 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FlgP11088 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FlgP11088 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FlgP11088 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FlgP11088 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FlgP11088 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FlgP11088 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FlgP11088 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FlgP11088 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FlgP11088 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FlgP11088 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FlgP11088 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.3 ms