Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP10400 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP10400 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP10400 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP10400 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP10400 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP10400 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP10400 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP10400 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP10400 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP10400 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP10400 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP10400 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP10400 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP10400 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP10400 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP10400 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP10400 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP10400 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP10400 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP10400 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP10400 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PolP10400 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolP10400 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolP10400 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PolP10400 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolP10400 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PolP10400 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PolP10400 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PolP10400 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PolP10400 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PolP10400 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PolP10400 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms