Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc9P09633 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hoxc9P09633 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc9P09633 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxc9P09633 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms