Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc8P09025 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc8P09025 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc8P09025 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc8P09025 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms