Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col3a1P08121 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col3a1P08121 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col3a1P08121 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col3a1P08121 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms