Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spta1P08032 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spta1P08032 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spta1P08032 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spta1P08032 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spta1P08032 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spta1P08032 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spta1P08032 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spta1P08032 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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