Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrlP06879 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrlP06879 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrlP06879 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrlP06879 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrlP06879 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrlP06879 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrlP06879 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrlP06879 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrlP06879 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrlP06879 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrlP06879 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrlP06879 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrlP06879 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrlP06879 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrlP06879 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrlP06879 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrlP06879 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PrlP06879 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrlP06879 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrlP06879 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrlP06879 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrlP06879 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrlP06879 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrlP06879 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrlP06879 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrlP06879 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrlP06879 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrlP06879 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrlP06879 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrlP06879 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrlP06879 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrlP06879 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrlP06879 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrlP06879 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrlP06879 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrlP06879 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrlP06879 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrlP06879 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrlP06879 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrlP06879 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrlP06879 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrlP06879 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrlP06879 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrlP06879 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrlP06879 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrlP06879 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrlP06879 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrlP06879 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrlP06879 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrlP06879 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrlP06879 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrlP06879 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrlP06879 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrlP06879 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrlP06879 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrlP06879 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrlP06879 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrlP06879 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrlP06879 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrlP06879 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrlP06879 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrlP06879 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrlP06879 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrlP06879 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrlP06879 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrlP06879 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrlP06879 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrlP06879 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrlP06879 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrlP06879 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrlP06879 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrlP06879 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrlP06879 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrlP06879 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrlP06879 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrlP06879 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrlP06879 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrlP06879 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrlP06879 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrlP06879 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrlP06879 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrlP06879 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrlP06879 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrlP06879 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrlP06879 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms