Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms