Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcraP01849 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcraP01849 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcraP01849 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcraP01849 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcraP01849 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcraP01849 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcraP01849 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcraP01849 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcraP01849 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcraP01849 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcraP01849 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcraP01849 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcraP01849 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcraP01849 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcraP01849 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcraP01849 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcraP01849 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TcraP01849 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TcraP01849 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TcraP01849 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TcraP01849 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TcraP01849 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TcraP01849 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TcraP01849 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TcraP01849 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TcraP01849 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TcraP01849 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TcraP01849 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TcraP01849 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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