Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01757 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01757 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01757 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01757 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01757 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01757 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01757 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01757 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01757 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01757 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01757 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01757 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01757 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01757 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01757 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01757 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01757 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01757 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01757 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01757 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01757 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01757 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01757 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01757 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01757 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01757 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01757 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01757 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01757 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01757 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01757 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01757 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01757 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01757 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01757 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01757 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01757 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01757 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01757 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01757 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01757 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01757 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01757 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01757 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01757 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01757 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms