Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01676 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01676 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01676 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01676 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01676 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01676 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01676 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01676 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01676 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01676 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01676 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01676 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01676 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01676 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01676 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01676 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01676 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01676 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01676 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01676 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01676 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01676 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01676 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01676 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01676 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01676 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01676 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01676 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01676 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01676 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01676 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01676 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01676 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01676 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01676 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01676 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01676 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01676 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01676 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01676 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01676 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01676 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.33■■□□□ 1
P01676 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01676 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01676 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01676 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01676 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01676 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01676 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01676 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01676 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01676 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01676 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01676 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01676 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01676 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01676 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01676 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01676 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01676 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01676 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01676 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01676 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01676 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01676 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms