Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifnb1P01575 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifnb1P01575 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifnb1P01575 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms