Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mtatp6P00848 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms