Protein–RNA interactions for Protein: P00342

Ldhc, L-lactate dehydrogenase C chain, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhcP00342 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LdhcP00342 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdhcP00342 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdhcP00342 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LdhcP00342 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LdhcP00342 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LdhcP00342 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdhcP00342 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdhcP00342 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdhcP00342 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdhcP00342 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LdhcP00342 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LdhcP00342 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdhcP00342 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdhcP00342 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdhcP00342 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdhcP00342 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LdhcP00342 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms