Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sp1O89090 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sp1O89090 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp1O89090 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp1O89090 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp1O89090 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp1O89090 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp1O89090 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sp1O89090 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp1O89090 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp1O89090 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp1O89090 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sp1O89090 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms