Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apba3O88888 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba3O88888 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba3O88888 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba3O88888 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba3O88888 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apba3O88888 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apba3O88888 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba3O88888 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apba3O88888 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba3O88888 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms