Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DcxO88809 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DcxO88809 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DcxO88809 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DcxO88809 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DcxO88809 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DcxO88809 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DcxO88809 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DcxO88809 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DcxO88809 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DcxO88809 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DcxO88809 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DcxO88809 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DcxO88809 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DcxO88809 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DcxO88809 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DcxO88809 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DcxO88809 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DcxO88809 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DcxO88809 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DcxO88809 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DcxO88809 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DcxO88809 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DcxO88809 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DcxO88809 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DcxO88809 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DcxO88809 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DcxO88809 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DcxO88809 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DcxO88809 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DcxO88809 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DcxO88809 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DcxO88809 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DcxO88809 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DcxO88809 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DcxO88809 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DcxO88809 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DcxO88809 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DcxO88809 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DcxO88809 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DcxO88809 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DcxO88809 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DcxO88809 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DcxO88809 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DcxO88809 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DcxO88809 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DcxO88809 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DcxO88809 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DcxO88809 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DcxO88809 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DcxO88809 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DcxO88809 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DcxO88809 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DcxO88809 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DcxO88809 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DcxO88809 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DcxO88809 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DcxO88809 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DcxO88809 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DcxO88809 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DcxO88809 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DcxO88809 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DcxO88809 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DcxO88809 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DcxO88809 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DcxO88809 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DcxO88809 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DcxO88809 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DcxO88809 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DcxO88809 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DcxO88809 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DcxO88809 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DcxO88809 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DcxO88809 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DcxO88809 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DcxO88809 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DcxO88809 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DcxO88809 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DcxO88809 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DcxO88809 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DcxO88809 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DcxO88809 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DcxO88809 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DcxO88809 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DcxO88809 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DcxO88809 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms