Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3bO88509 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3bO88509 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnmt3bO88509 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms