Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh7O88451 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh7O88451 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms