Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klc1O88447 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klc1O88447 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc1O88447 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc1O88447 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc1O88447 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc1O88447 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klc1O88447 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc1O88447 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc1O88447 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc1O88447 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc1O88447 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc1O88447 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms