Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkcO88445 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkcO88445 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkcO88445 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkcO88445 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AurkcO88445 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AurkcO88445 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AurkcO88445 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkcO88445 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkcO88445 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkcO88445 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AurkcO88445 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AurkcO88445 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AurkcO88445 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AurkcO88445 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AurkcO88445 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AurkcO88445 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AurkcO88445 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkcO88445 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkcO88445 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AurkcO88445 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AurkcO88445 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AurkcO88445 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AurkcO88445 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AurkcO88445 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkcO88445 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkcO88445 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AurkcO88445 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms