Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme6O88425 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme6O88425 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme6O88425 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme6O88425 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme6O88425 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme6O88425 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme6O88425 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme6O88425 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms