Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clec11aO88200 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec11aO88200 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clec11aO88200 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec11aO88200 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms