Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1O70583 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1O70583 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid1O70583 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1O70583 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1O70583 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid1O70583 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1O70583 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms