Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp9aO70228 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp9aO70228 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp9aO70228 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp9aO70228 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms