Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf5O70191 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf5O70191 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atf5O70191 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atf5O70191 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atf5O70191 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf5O70191 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf5O70191 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf5O70191 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf5O70191 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf5O70191 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf5O70191 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf5O70191 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf5O70191 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms