Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sigmar1O55242 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sigmar1O55242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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