Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd70O55237 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd70O55237 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd70O55237 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd70O55237 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd70O55237 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd70O55237 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd70O55237 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd70O55237 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd70O55237 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd70O55237 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd70O55237 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd70O55237 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd70O55237 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd70O55237 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms