Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChkbO55229 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChkbO55229 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChkbO55229 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChkbO55229 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkbO55229 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChkbO55229 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkbO55229 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChkbO55229 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkbO55229 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkbO55229 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms