Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mmp10O55123 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp10O55123 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp10O55123 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms