Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bnip3O55003 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bnip3O55003 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bnip3O55003 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bnip3O55003 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bnip3O55003 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms