Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajb6O54946 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dnajb6O54946 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnajb6O54946 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnajb6O54946 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajb6O54946 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms