Protein–RNA interactions for Protein: O54714

Pias3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias3O54714 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias3O54714 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias3O54714 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias3O54714 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias3O54714 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias3O54714 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias3O54714 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias3O54714 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pias3O54714 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pias3O54714 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms