Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klrk1O54709 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Klrk1O54709 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klrk1O54709 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klrk1O54709 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Klrk1O54709 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms