Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccr6O54689 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccr6O54689 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccr6O54689 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr6O54689 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms