Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1aO35526 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx1aO35526 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx1aO35526 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1aO35526 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms