Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk2O35491 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clk2O35491 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk2O35491 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk2O35491 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clk2O35491 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk2O35491 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk2O35491 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clk2O35491 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk2O35491 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk2O35491 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk2O35491 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk2O35491 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clk2O35491 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clk2O35491 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clk2O35491 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms